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Die Agenten G. Callen und Sam Hanna gehören zu einer Undercover-Einheit des "Navy CIS" in Los Angeles. Sie sollen die USA vor Bedrohungen schützen. Hanna spricht fließend arabisch, während Callen sich hervorragend in die unterschiedlichsten Menschen hineinversetzen kann. Geleitet wird ihr Team von der entschlossenen Henrietta Lange: Aiden Hannas Flugzeug stürzt ab und er wird beschuldigt, Schuld an dem Unfall zu sein. Das NCIS-Team muss ohne Sam ermitteln, um seinen Namen reinzuwaschen ...