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Ein gefährliches Virus mit dem Namen "Compound X" gerät in Umlauf und Sam infiziert sich mit dem Erreger. Während der Agent unter schwerwiegenden Symptomen leidet, versucht sein Team gemeinsam mit Dr. Chase ein Gegenmittel zu finden. Außerdem muss die Navy dafür sorgen, dass der Wirkstoff nicht in falsche Hände gerät. Denn offenbar verfolgt eine Terrorgruppe den perfiden Plan, die Viren als Waffe einzusetzen ...